1.MF方法
水分析的典型的MF方法是通过使已知体积的水通过孔径足够小以消除细菌细胞（通常为0.45μm）的无菌膜过滤器来进行的。然后将过滤器无菌地转移到琼脂板的表面或用合适的选择性培养基饱和的吸收垫。允许在过滤器的表面上发育，饮用水两虫检测仪器，并且可以直接计数和检查。MF方法快速且易于执行，需要很少的孵化器空间，并且可以处理非常大量的水。在过去30年中两虫检测系统已经成为用于指示生物的水的微生物检查的方法。
2.快速检测方法
虽然微生物水分析的大多数人仍然依赖于传统的培养方法和MF方法。但获得结果所需的时间比较长，对于一些特定的微生物我们可以使用一些快速分析法，比如利用定量PCR（QPCR）技术的方法可以快速检测指示生物菌和特定病原体，尤其是在MF分析法相结合时是快速有效的手段，但检测一些没有活性细胞时数据会偏高。
水污染是饮用水中两种昆虫存在的主要原因。饮用水源经常被发现含有两种昆虫。虽然中国没有关于两种昆虫疾病的大规模报道。然而，随着人们生活水平的提高和饮用水习惯的提高，饮用水两虫检测仪，饮用水中的微生物安全问题逐渐突出。由两种昆虫引起的疾病不容忽视。
目前，两虫检测基本上在美国使用WSEPA1623方法。这种方法的主要步骤是过滤、洗脱、浓缩、分离纯化、荧光显色和镜检。DAPI染色和微分干涉显微镜观察也可以确认卵囊和囊的存在。该方法具有较高的回收率和良好的准确性，但不能区分无活性的两种昆虫和具有活力的两种昆虫。各国的研究人员仍在研究各种改进方案。
利用去除有机杂质，利用消除絮凝剂的影响
由于再生水的水质具有有机物、微生物等含量高的特点，江苏饮用水两虫检测，在样品预处理中需要去除各种干扰显微镜检查的杂质。另一方面，饮用水两虫检测装置，再生水目前采用不同的处理工艺，其中常规的混凝处理造成水中残留的混凝剂会影响两虫的分离。利用去除有机杂质，利用消除絮凝剂的影响，建立了应用于再生水的“两虫”检测方法。再生水进出水隐孢子虫卵囊和贾第鞭毛虫包囊的回收率分别为18%-31%和24%-95%，我国规定饮用水中两虫检测的初始回收率要求控制在10%-(GB/T 5750.12-2006)。
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